L'intelligence artificielle est en train de bouleverser les sciences de la vie et la médecine. Grâce à sa position de leader dans la fourniture de bases de données et d'outils logiciels de haute qualité, le SIB a le potentiel pour être un moteur de cette transformation. C'est pourquoi le SIB a lancé en mars 2022 un appel à projets visant à apporter une valeur ajoutée à l'impact scientifique des Ressources du SIB, tout en proposant des technologies innovantes qui bénéficieront à la communauté scientifique.
Cinq projets parmi les nombreux projets soumis ont été sélectionnés à l'issue d'un processus en trois étapes : 1) évaluation qualitative de chaque projet par un panel de 3-4 évaluateurs ; 2) classement basé sur les commentaires des évaluateurs par Carlos Pena et Fabio Rinaldi, deux éminents experts en IA/ML au SIB ; 3) sélection basée sur les recommandations des experts et l'orientation stratégique du SIB par les représentants des chefs de groupe au sein du conseil d'administration du SIB, Katja Baerenfaller et Robert Waterhouse. Les projets sélectionnés sont les suivants :
- The Missing Link : augmentation par l'IA des graphes de connaissances RDF du SIB - groupes de Christophe Dessimoz et Christian von Mering – Ressources : STRING et OMA
- The Protein Universe Atlas - Utilisation de l'apprentissage profond pour modéliser le paysage de l'univers des protéines - Groupe Torsten Schwede – Ressources : SWISS-MODEL, UniProtKB/Swiss-Prot et SwissOrthology
- Développement d'une nouvelle fonction de notation basée sur l'apprentissage automatique pour prédire l'effet néfaste des mutations sur les structures protéiques - Olivier Michielin & Vincent Zoete et les groupes Clinical Bioinformatics – Ressource : SwissDrugDesign
- Mise en œuvre pilote de l'annotation de données RNA-Seq unicellulaires guidée par l'IA - Marc Robinson-Rechavi & Frédéric Bastian, Bart Deplancke et Mark Robinson groups – Ressources : Bgee et ASAP
- Utilisation de transformateurs pour faciliter la biocuration des lignées cellulaires - Amos Bairoch & Lydie Lane et Patrick Ruch – Ressource : Cellosaurus
Félicitations aux candidats retenus et merci à toutes les personnes qui ont participé au processus ! Pour plus d'informations, veuillez contacter Severine Duvaud, Ressources, Accessibilité et Assistance.