SWISS BIOINFORMATICS

Depuis 1998, l’une des principales missions du SIB consiste à fournir aux chercheurs en sciences de la vie, en Suisse et au-delà, des encyclopédies biologiques, bases de données et outils essentiels.
Un exemple phare de ces ressources est UniProt, la référence mondiale pour les séquences et fonctions des protéines, dont la partie manuellement annotée est principalement entretenue et développée par le groupe Swiss-Prot du SIB.
De telles ressources sont utilisées quotidiennement par les scientifiques du monde entier pour favoriser l’innovation et améliorer la santé. Cependant, avec plus de 60% des bases de données en sciences de la vie bénéficiant de moins d’un an de financement, leur viabilité financière est une source de préoccupation croissante sur le plan international.
Dans notre newsletter précédente, nous annoncions que le SIB avait rejoint un groupement mondial visant à assurer la pérennité à long terme de bases de données cruciales. Une première proposition audacieuse a été émise par ce groupement début juin. Son adoption pourrait conduire à des avancées déterminantes dans la gestion des ressources de données à l’avenir.
Une distinction de premier plan pour un scientifique du SIB; les dernières nouvelles de l’Institut sur le front de la santé personnalisée; le secret de la couleur d’un lézard et les récents événements de bioinformatique pour tous viennent compléter les titres de cette édition de juin de Swiss Bioinformatics.

Et si les bases de données étaient financées via un pot commun, plutôt que de manière fragmentée comme c’est le cas aujourd’hui ? Voici, en substance, la proposition audacieuse présentée par le groupement Global Life Sciences Data Resources (GLSDR) aux dirigeants d’organismes internationaux de recherche (HIROs). Elle résulte d’un atelier de 2 jours au cours duquel la Suisse était représentée par le SIB et le SEFRI…

Entrepreneurs, scientifiques, journalistes, artistes... Chaque année, le Forum des 100 recense et rassemble 100 personnalités qui contribuent au dynamisme et à l’esprit d’innovation de la Suisse romande. Le professeur Ioannis Xenarios fait partie des lauréats de la 13^e édition, qui s’est déroulée le 11 mai à l’Université de Lausanne, et qui était dédiée à la Santé – du Big Data à la médecine personnalisée.

Les inscriptions sont ouvertes pour l’événement Suisse de l’année en biologie computationnelle ! Cette édition de [BC]² se tiendra du 13 au 15 septembre à Bâle, et proposera une excellente sélection d’intervenants de marque et de sessions thématiques. [BC]² est le colloque scientifique biennal du SIB, organisé en collaboration avec le Biozentrum - Université de Bâle. Il réunit des scientifiques en bioinformatique, neurosciences, médecine…

Permettre aux projets de recherche de collaborer et de partager des données entre hôpitaux et institutions de recherche suisses : c’est l’objectif du groupe SIB Personalized Health Informatics, qui constitue le centre de coordination des données de l’initiative SPHN. Le recrutement d’experts en gestion et sécurité des données a débuté. Pour en savoir plus sur le rôle du SIB au sein de SPHN, visitez le nouveau site web de l’initiative.

En quoi la bioinformatique peut-elle aider les médecins à prendre des décisions dans leur pratique ? Cette question était au cœur d’un événement C-Suite organisé au Biopôle de Lausanne le 13 juin dernier. Torsten Schwede, directeur du groupe SIB Personalized Health Informatics faisait partie des intervenants et a présenté le rôle du groupe dans l’initiative Swiss Personalized Health Network.

Découvrez comment Michel Milinkovitch, chef de groupe au SIB, et ses collègues ont résolu le mystère des écailles colorées du lézard ocellé dans une étude publiée dans Nature...

Il est désormais possible de prédire quand et comment les espèces apparaissent, grâce à un nouveau modèle théorique utilisant des données pangénomiques développé par le chercheur Simon Aeschbacher du SIB et ses collègues. Leur étude a été publiée ce mois-ci dans Proceedings of the National Academy of Sciences…

«Créer une application 3D qui utilise la réalité virtuelle/augmentée pour aider à comprendre les sciences de la vie». Avec cet objectif en tête, les seize participants au premier hackathon de bioinformatique du SIB se sont réunis pour rendre la science ludique les 13 et 14 mai 2017 sur le Campus Biotech à Genève. Après une brève présentation, quelques croissants et bien plus de cafés, les équipes ont élaboré plusieurs projets prometteurs…

Plus de 650 personnes, dont plusieurs groupes scolaires, ont participé aux activités de vulgarisation de la bioinformatique à l’occasion des portes ouvertes de l’Université de Lausanne (Mystères de l’UNIL) et de la Nuit des Musées à Genève, du 18 au 21 mai. Ces deux événements ont connu un franc succès…

Il arrive que les choses soient si sombres que la lumière peine à briller. Nous pouvons créer notre propre lumière, ou nous adapter à son absence. Dans la Nature, les poissons vivent dans la mer ou dans l'eau douce. Les rivières, cependant, peuvent être troubles, et les poissons d'eau douce utilisent des systèmes visuels différents de ceux des poissons marins. Qu’en est-il des poissons qui vivent dans les deux milieux ? Une enzyme serait la clé...